分子生物学インターネットツール解説

バイオインフォマティクス(Bioinformatics)

本ページは単に個人的な覚えとして記載していますので、利用の際には注意してください。

遺伝子配列の検索

GenBankへアクセス

例;ヒトのTSHβの遺伝子配列を検索したい場合

 「human TSH beta」 と入力。 種も入力します。ギリシア文字は「β」なら「beta」などと入力。

 検索結果の最下段にシークエンスが出ていますので、そこの「ORIGIN」(「SQ」となっている時もあります。)をクリックすると、

 文字情報として塩基配列として手に入れることができます。

 これをコピーして次の解析に利用していきます。

配列比較

 次にヒトとマウスの配列を比較します。

 ClastalWにアクセス

 先の解説の手順でヒトとマウスの配列を手にいれ、それぞれをコピー、ペースとします。

 「>」以下にhumanやmouseなどと入力してそれぞれの配列を入力します。

例えば 「>human
      agtcagtc・・・・
     >mouse
      agtcagtc・・・・」などと入力して  解析を行うと結果が表示されます。

解説サイト

基礎編(cDNA?, mRNA?, プロモーター???なんて言うヒトはまずこちらから)

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